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भारतीय शहरों को उन लोगों के समूह द्वारा आतंकित किया जा रहा है जो सरकार को अपनी मांगों को पूरा करने के लिए चाहते हैं और इस उद्देश्य के लिए किसी भी हद तक जाने को तैयार हैं। ईमानदार, अनुभवी और मेहनती पुलिस अभय सिंह (ओम पुरी) और अब्बास लोदी (नसीरुद्दीन शाह) सरकार द्वारा इस खतरे को खत्म करने के लिए स्थापित आतंकवाद टास्क फोर्स का हिस्सा हैं।
अब्बास लोधी "ऑपरेशन धनुष" के विचार से आते हैं, जिसमें आतंकवादी समूह के बीच दो मुखी पुलिस अफसरों आनंद (मनोज वाजपेयी) और शिव (मिलिंद गुनाजी) को भेजने की जरूरत है, ताकि वे उन का हिस्सा हो सकें और उनके बारे में सब कुछ सीख सकें, और उसे रेडियो के माध्यम से कॉल कर सकते हैं और सभी जानकारी को कोड नाम धनुष के नीचे प्रसारित कर सकते हैं। केवल अब्बास और अभय इस ऑपरेशन के बारे में जानते हैं।
आनंद, एक गुप्त पुलिस में से एक, कुछ साल बाद आतंकवादियों द्वारा उजागर किया जाता है। हालांकि, वह साइनाइड का उपभोग करके मर जाता है और इससे पहले कि वह उससे कोई सूचना प्राप्त कर सकें। अब शिव को गिरोह में अकेला छोड़ दिया गया है। वह जल्द ही गिरोह में हर किसी के विश्वास और सम्मान जीत लेते हैं, जिसमें मास्टरमाइंड कमांडर भद्र (आशीष विद्यार्थी) भी शामिल हैं।
पुलिस ने भद्र को पकड़ा और अत्याचार किया। लेकिन कोशिश करें कि वह अब्बास या अभय को कुछ भी प्रकट न करें और अपने कार्यों को सही ठहराए। जब भद्र जेल में है, तो गिरोह उनके तेज निशानेबाजों में से एक को मंत्री को मारने के लिए नियुक्त करता है क्योंकि वह अपनी गाड़ी में शहर के पास आ रहा है, जो वह सफलतापूर्वक करता है। इस व्यक्ति को अभय से गिरफ्तार किया गया और उससे पूछताछ की गई। वह अपने परिवार की सुरक्षा के लिए पुलिस की मदद के लिए सहमत हैं, लेकिन जल्द ही एक भ्रष्ट पुलिस निरीक्षक तिवारी (श्रीवल्लभ व्यास) द्वारा जेल में जहर जला दिया जाता है।